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mRNA测序是研究原生生物转录组的有效手段，可以直接对特定样品在某一状态下产生的所有mRNA进行高通量测序，在获得基因表达信息的同时，推测mRNA的表达量，对基因进行注释等

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焦磷酸测序技术（Pyrosequencing）作为一种新的序列分析技术，能够快速地检测甲基化的频率，对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测，为甲基化研究提供了新的途径。

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核糖体印迹测序又称Ribosome profiling，或Ribo-seq，是运用测序手段研究翻译组学的一种主要的技术手段。

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